Laboratorio de Bioinformática Dr. Arturo Melo

INDICASAT AIP, Panamá

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Agrupamiento de genomas basado en el orden de los genes usando matrices de adyacencia

Este proyecto está encaminado a desarrollar e implementar una metodología para agrupar genomas según similitud en el orden de los genes, utilizando matrices de adyacencia. Esta metodología fue inicialmente diseñada para genomas circulares (mitocondriales), pero puede ser fácilmente adaptada a genomas lineales con varios cromosomas. En la implementación de la metodología ha colaborado Marc Brooks, un interno recién graduado de la Universidad de California, Berkeley en la espacialidad de Matemática Aplicada.

Recursos

La metodología se está implementando en la forma de un servidor web y un programa local llamados FIGG. Ambos estarán disponible cuando termine la fase de implementación.